SecReT4
Protein ID: 190571010
T4SS name [ID]VirB [485]
Gene symbol-
Locus tagWPa_0602
StrainWolbachia endosymbiont of Culex quinquefasciatus Pel
Repliconchromosome [GenBank: NC_010981] [Browse all T4SS(s) in this replicon]
Location [Strand]652573..655149 [-]
Producttype IV secretion system protein VirB6
Component typeVirB6
UniProt IDB3CLE2
KEGG IDwpi:WPa_0602
PDB IDNA
Domain hit(s) vs Pfam TrbL [PF04610], Evalue: 5.5e-11, Aligned region: 576..677
Protein Sequence: 858 a.a.     [Download]
>gi|190571010|ref|YP_001975368.1| type IV secretion system protein VirB6 [Wolbachia endosymbiont of Culex quinquefasciatus Pel]
MFKTKLSLLLVAIFLLNIDFLLSYPVFADTVSGTDKTEFVSRFNSTGSFSRASNPDCKAFETAAAVAGIA
IAIGAIFTGIVLIVSSAGLFTALVIVGMIAAIVGVWKAIGGLVVCEHSFVKHPVARDHDGKYKDFEFSKS
EYSKYSDCTNKNYQKEDEYFKCFDGANGSIEVGRKIEKGILNSIPDQNTGGYYWPKNGVQYSEYIEVCHR
NPLTFSRLFWLDTSIKADFDVREKDTGYEGGSWSPKVDGDLECKVLKAGQSETIHGSTFKAVKKMDRLCV
ELASVRMLGIKMTPWPQGVDMGCTELPPDPLAPMCEKSVMIFKNKDGTGEYEEDLNDSKNKDKDYKTIIR
EKKGEGKIFVGYNNASCFSQYVSEACYNQAGSKSLSPIPITSMIVQCIKESLDNLVAGIDSSGNLLTDKN
GHAKGSFLSVAQKRLKNTVTAILILALILFSIKVMSGGVRSPQEMYMLIIKFALVIYFTTGSTMSHYYGE
LTKLSNGLSEIVLKASSESKNICNYEAGKDYEYDRAGQKVSYSYLAPWDRLDCRILFYLGAPLDGIGGKI
GTGGVATLAVLLGAAPVLLVAGSVIGIIFAGGQILVALVCIFMAILMMMVILWMCYVFILSLVALSVIII
LSPLFIPMVLFQHTKGYFDGWLKELITYSLYPVILFAFLSFMFIACDKIYFKNLNFKLDESYKNEQPDKS
YEKKQAEISYSKKKQWFKLKDGECDKNETTLACMMQNYSFKKSSILGLFDFRYMEFGSSLIGELLKLCLV
LFLFYHFLNVLPGMAAELAGNHRAALGSGSTPAQMVNKALSAAKAAAGGAGQVAAAAVNKARGAIGGGGD
DNKGSGSSSSESIKSGGE
 
Nucleotide Sequence: 2577 bp     [Download]
>gi|190570478|ref|NC_010981.1|:c655149-652573 Wolbachia endosymbiont of Culex quinquefasciatus Pel chromosome, complete genome
ATGTTTAAAACTAAACTGTCATTACTGTTAGTTGCGATATTTTTGTTAAATATAGATTTTTTGCTCTCGT
ATCCAGTGTTTGCAGATACAGTAAGTGGTACTGACAAAACGGAATTTGTTAGCAGATTTAATTCTACTGG
CAGCTTTAGTCGTGCTTCTAATCCTGACTGTAAGGCGTTTGAAACAGCTGCAGCAGTTGCTGGGATAGCA
ATTGCTATTGGTGCAATATTTACTGGTATTGTTTTGATTGTCTCTTCTGCTGGTTTATTTACTGCTCTTG
TTATCGTTGGAATGATAGCTGCAATTGTTGGGGTTTGGAAGGCGATAGGAGGACTTGTTGTTTGTGAGCA
TAGTTTTGTTAAACACCCAGTTGCACGTGATCATGATGGAAAGTATAAAGATTTCGAATTCTCAAAATCA
GAATACTCAAAATATTCAGATTGCACAAATAAGAATTATCAAAAGGAAGATGAATATTTTAAATGTTTTG
ATGGGGCAAATGGATCAATAGAAGTAGGTAGAAAAATAGAGAAGGGCATTTTAAACTCCATACCTGACCA
AAATACTGGTGGTTATTACTGGCCAAAAAACGGTGTGCAATACAGTGAATATATAGAAGTATGCCATAGA
AATCCTTTAACATTTAGCAGATTGTTTTGGTTAGATACATCAATAAAAGCAGACTTTGATGTTAGAGAGA
AGGACACTGGATATGAAGGTGGGTCATGGTCTCCAAAAGTTGATGGTGATCTGGAATGTAAAGTTCTTAA
AGCAGGACAAAGCGAAACCATACATGGGTCAACATTCAAGGCAGTAAAAAAAATGGACAGATTGTGTGTG
GAGCTGGCAAGTGTGAGAATGCTTGGTATCAAAATGACTCCTTGGCCGCAAGGGGTTGATATGGGATGCA
CAGAATTGCCACCTGACCCACTTGCTCCTATGTGTGAAAAATCTGTGATGATATTCAAAAATAAAGATGG
TACAGGTGAATATGAGGAAGATCTTAATGATTCTAAAAATAAGGACAAAGATTACAAAACTATTATAAGG
GAAAAGAAAGGAGAGGGAAAAATTTTTGTAGGTTATAATAATGCCAGTTGTTTTAGCCAGTATGTCTCTG
AAGCTTGCTACAATCAAGCGGGAAGTAAGTCATTATCTCCTATTCCTATAACTTCTATGATAGTGCAATG
TATTAAGGAGTCGTTAGATAATTTAGTGGCAGGTATTGATTCAAGTGGTAACTTACTTACAGACAAAAAT
GGACATGCTAAGGGTAGTTTTTTGTCTGTAGCACAAAAAAGACTGAAGAACACTGTTACTGCTATCTTAA
TTTTAGCTTTGATATTGTTCTCTATAAAAGTTATGTCTGGTGGAGTGCGTAGTCCGCAAGAAATGTACAT
GTTGATCATTAAATTCGCTTTAGTGATTTACTTTACGACAGGTAGCACTATGTCTCATTATTACGGGGAA
TTAACAAAACTTTCGAACGGCTTATCAGAAATAGTGCTTAAAGCTTCATCTGAGAGTAAAAATATATGTA
ATTATGAGGCAGGTAAAGATTATGAATACGATCGTGCAGGGCAGAAGGTATCCTACAGTTATCTTGCACC
TTGGGATAGGCTTGATTGCAGAATTTTATTTTATTTAGGTGCCCCTTTAGATGGAATTGGTGGCAAAATT
GGTACTGGAGGTGTTGCAACGTTAGCGGTCTTGCTTGGCGCTGCTCCTGTCTTGTTAGTTGCAGGTTCGG
TGATTGGTATTATTTTCGCTGGTGGACAAATTTTAGTAGCTCTTGTCTGTATATTTATGGCCATTTTGAT
GATGATGGTTATTTTATGGATGTGCTATGTATTTATCTTATCTTTAGTTGCGCTTAGTGTAATTATCATC
TTATCGCCTTTATTCATTCCTATGGTTTTGTTTCAACATACTAAAGGATATTTTGATGGTTGGCTAAAAG
AGTTAATTACCTACAGTTTATACCCAGTTATCCTCTTTGCATTTCTATCTTTTATGTTCATAGCATGTGA
TAAAATCTATTTTAAAAATTTAAATTTTAAACTGGACGAGTCATATAAAAATGAACAACCAGACAAGTCA
TATGAAAAGAAACAAGCAGAAATCTCATATAGTAAGAAAAAACAGTGGTTTAAATTGAAAGATGGGGAAT
GTGATAAAAATGAAACTACTCTCGCATGTATGATGCAAAATTATAGCTTTAAAAAGAGCAGCATACTTGG
TCTATTCGACTTTAGATACATGGAGTTTGGCAGCTCTCTAATCGGAGAATTATTAAAATTGTGTTTAGTA
TTATTCCTCTTTTACCACTTTTTAAACGTTCTTCCCGGCATGGCTGCTGAGCTTGCTGGTAATCACAGAG
CAGCACTTGGTTCAGGTAGCACTCCTGCACAAATGGTGAATAAAGCTTTATCTGCTGCCAAAGCTGCTGC
TGGAGGTGCTGGTCAAGTTGCTGCTGCGGCTGTAAATAAGGCAAGAGGGGCTATTGGAGGAGGTGGAGAT
GATAATAAGGGATCGGGATCTTCCTCTAGTGAATCTATAAAATCAGGTGGAGAGTGA
 Primer design