SecReT4
Protein ID: 51473246
T4SS name [ID]VirB [498]
Gene symbolvirB4a
Locus tagRT0033
StrainRickettsia typhi str. Wilmington
Repliconchromosome [GenBank: NC_006142] [Browse all T4SS(s) in this replicon]
Location [Strand]44546..46963 [-]
Producttype IV secretion system ATPase VirB4
Component typeVirB4
UniProt IDQ68XX1
KEGG IDrty:RT0033
PDB IDNA
Domain hit(s) vs Pfam CagE_TrbE_VirB [PF03135], Evalue: 7e-68, Aligned region: 194..399
AAA_10 [PF12846], Evalue: 7.1e-37, Aligned region: 452..727
AAA_23 [PF13476], Evalue: 1.3e-05, Aligned region: 444..576
Protein Sequence: 805 a.a.     [Download]
>gi|51473246|ref|YP_067003.1| type IV secretion system ATPase VirB4 [Rickettsia typhi str. Wilmington]
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SGRVETVILLDQIRDKYGNDPDKWLPIFYEAVKTL
 
Nucleotide Sequence: 2418 bp     [Download]
>gi|51473215|ref|NC_006142.1|:c46963-44546 Rickettsia typhi str. Wilmington, complete genome
ATGAAGTTATTTAGAACTAGAACAGCTAAAGAATTAAGGTCTAAACAAGAAAGACCAACTTCGCATTTTA
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TCTGGCAGAGTTGAAACTGTAATATTGCTTGATCAAATTAGAGATAAATACGGCAATGATCCGGATAAGT
GGTTACCTATATTTTATGAAGCAGTTAAAACATTATAG
 Primer design

Protein ID: 51473952
T4SS name [ID]VirB [498]
Gene symbolvirB4b
Locus tagRT0771
StrainRickettsia typhi str. Wilmington
Repliconchromosome [GenBank: NC_006142] [Browse all T4SS(s) in this replicon]
Location [Strand]982177..984609 [+]
ProductVirB4 protein precursor
Component typeVirB4
UniProt IDQ68VW5
KEGG IDrty:RT0771
PDB IDNA
Domain hit(s) vs Pfam CagE_TrbE_VirB [PF03135], Evalue: 3.9e-51, Aligned region: 183..383
AAA_10 [PF12846], Evalue: 3.5e-08, Aligned region: 436..612
Protein Sequence: 810 a.a.     [Download]
>gi|51473952|ref|YP_067709.1| VirB4 protein precursor [Rickettsia typhi str. Wilmington]
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IVRILSSRQEEMDIYKKILQEHNGPPDNWINYLYNALNIY
 
Nucleotide Sequence: 2433 bp     [Download]
>gi|51473215|ref|NC_006142.1|:982177-984609 Rickettsia typhi str. Wilmington, complete genome
GTGTTTAGTGATTTACGGAAATTTGACAAAGATATATATAATTATAATGCGCCTAATTTTATACCTATAG
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AATTAATCAGTGGTCATTATATTTCACCACTTAGTGAAATCGAGATATCTTTTCTAGAAAAATTGAAAAA
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ATGGGCCATCTCTTAACATTAAAGAAGGCGAAGTGATAGGGTTTAACTTATATACACTTTCTGATGAGCC
GTTTTCTAAACAATTCTATCCAATGGAGAGAAAATTTTTAGAACAATTTAATCATAATTTAAAAAAACAC
CAAAGTATTAGTGCAGCAGTAATTTATGCTTTGAGTTATAATTTAAGCATACTTGGCACAAAACCTAAAA
TATTTGCTGCTGATAATTTTGATCAACTTTACAGACCTGAATCTTATTATGATAATATAAATTTAATCTA
TAATAATTTATCAGAAAATAATGGTATTTTTGTCAGTAATTTCAATTTTATTTATCTTAAATCATATCCA
AAATATACTATAAAACCTTGGCTTGATTTAATTAATACTAAAATTATACTGCCCTCTGACGTTAAAATAG
AAGATTTAGATAAAATTTTAGGTTTAAGTGAATTGGAAATACGAAAATTATCACAGCTAATACTTTCTGC
AAGAATGTTCTTAATTAATAAAGATAATGAATCAATTGCTTCTGAATTAAGTATTGCAGCTTTAATAGGT
ATTGTACGTATTTTATCAAGCAGACAAGAGGAAATGGATATTTATAAAAAAATACTTCAAGAACATAACG
GTCCTCCAGATAATTGGATTAATTATCTATATAATGCGTTAAATATATACTAA
 Primer design